RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 APBA3O96018 575 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 RLBP1P12271 317 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF174Q15697 407 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 PPIP5K2O43314 1243 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 HDXQ7Z353 690 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 MED14O60244 1454 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 POLR2MP0CAP2 368 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 HSPA2P54652 639 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 BIRC3Q13489 604 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 G2E3Q7L622 706 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 DNAI1Q9UI46 699 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SEPT2Q15019 361 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 AK8Q96MA6 479 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 USP40Q9NVE5 1235 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 GTF3C6Q969F1 213 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 E7EWF7 191 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TFDP1Q14186 410 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PPP2R5AQ15172 486 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 BEND3Q5T5X7 828 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRB3O60242 1522 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 AOC3Q16853 763 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 KRT40Q6A162 431 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZEB2O60315 1214 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 OSBPP22059 807 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF445P59923 1031 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ERO1AQ96HE7 468 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CDHR1Q96JP9 859 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LGR6Q9HBX8 967 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IFNKQ9P0W0 207 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 GAP43P17677 238 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SETDB1Q15047 1291 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 POSTNQ15063 836 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF11Q86T75 865 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IFT20Q8IY31 132 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ABCC12Q96J65 1359 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 RGS12O14924 1447 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 INF2Q27J81 1249 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ADALQ6DHV7 355 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC169A6NNP5 214 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP6O43182 974 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ALCAMQ13740 583 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TRPC6Q9Y210 931 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 KRT5P13647 590 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 TERF1P54274 439 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ODR4Q5SWX8 454 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 BLIDQ8IZY5 108 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms