RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.24■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.23■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 TRIB2Q92519 343 aa29.23■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 RAB11FIP3O75154 756 aa29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 CCNA1P78396 465 aa29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 Q3C1V9 767 aa29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 PRO3102Q9H379 93 aa29.22■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 A0A1W2PPC1 479 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 PDE6AP16499 860 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 RGS2P41220 211 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 PLCD1P51178 756 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 GPR142Q7Z601 462 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 USP6NLQ92738 828 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 NBPF3Q9H094 633 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 NAV1Q8NEY1 1877 aa29.21■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ACVR1B-204ENST00000536420 SHMT1P34896 483 aa29.2■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.2■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.2■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.2■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 TRIM32Q13049 653 aa29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 MORN1Q5T089 497 aa29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 LBX2Q6XYB7 198 aa29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 PORCNQ9H237 461 aa29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ALPK3Q96L96 1907 aa29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 PEX10O60683 326 aa29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 GABPAQ06546 454 aa29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 MCM9Q9NXL9 1143 aa29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.18■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 GOLIM4O00461 696 aa29.17■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 VCAM1P19320 739 aa29.17■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 APBB1O00213 710 aa29.16■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.16■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 APBA2Q99767 749 aa29.16■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP2K5Q13163 448 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 ACER1Q8TDN7 264 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 COG6Q9Y2V7 657 aa29.15■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 MYH8P13535 1937 aa29.14■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 SWAP70Q9UH65 585 aa29.14■■■□□ 2.26
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 CNMDO75829 334 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 GUCY1A2P33402 732 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 SEPT2Q15019 361 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 SZT2Q5T011 3432 aa29.13■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP5JP18859 108 aa29.12■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.12■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.11■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 LCORLQ8N3X6 602 aa29.11■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.11■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPREP23469 700 aa29.1■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 ADD2P35612 726 aa29.1■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 COG2Q14746 738 aa29.1■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 HOXC6P09630 235 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 BMP8BP34820 402 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 CCL14Q16627 93 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 WDR78Q5VTH9 848 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 MYH7P12883 1935 aa29.09■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 LHX8Q68G74 356 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 HAUS7Q99871 368 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 SH2D4AQ9H788 454 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 ARMT1Q9H993 441 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 BTBD7Q9P203 1132 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 STAP2Q9UGK3 403 aa29.08■■■□□ 2.25
ACVR1B-204ENST00000536420 STRNO43815 780 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 GRB14Q14449 540 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 UBE3CQ15386 1083 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms