RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MFAP3L	O75121	409 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DHX58	Q96C10	678 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PNKP	Q96T60	521 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RAI14	Q9P0K7	980 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CAMTA2	O94983	1202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DEXI	O95424	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SLC5A1	P13866	664 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	EVX2	Q03828	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA1	Q5VX52	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CARD6	Q9BX69	1037 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	KLRC4	O43908	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NOV	P48745	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ST5	P78524	1137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	FANCB	Q8NB91	859 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MBD4	O95243	580 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RBL2	Q08999	1139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF827	Q17R98	1081 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	WASHC4	Q2M389	1173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SPECC1	Q5M775	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SUSD4	Q5VX71	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	WDR59	Q6PJI9	974 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	JMY	Q8N9B5	988 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF592	Q92610	1267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	KRT23	Q9C075	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	FLT1	P17948	1338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	EDIL3	O43854	480 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ATF3	P18847	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TXLNA	P40222	546 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2R5B	Q15173	497 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MEA1	Q16626	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	METTL24	Q5JXM2	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MICU3	Q86XE3	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	EPSTI1	Q96J88	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GSDMA	Q96QA5	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC7	Q99615	494 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SNED1	Q8TER0	1413 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZSCAN12	O43309	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GNAT2	P19087	354 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	WDR93	Q6P2C0	686 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CNNM3	Q8NE01	707 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SNAP23	O00161	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RGL2	O15211	777 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PPARA	Q07869	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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