RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDF11	O95390	407 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP2C19	P33261	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP14	P54578	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRB14	Q14449	540 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	JAG1	P78504	1218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNX17	Q15036	470 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEPT4	O43236	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	STRN	O43815	780 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	CNMD	O75829	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYBA	P13498	195 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLA2G5	P39877	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TFCP2	Q12800	502 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	NCOR1	O75376	2440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	GH2	P01242	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP4C	P60510	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	TLE2	Q04725	743 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	FLT1	P17948	1338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLTB	P09497	229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAG1	P15918	1043 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJB2	P25686	324 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADORA2A	P29274	412 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	FPGS	Q05932	587 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRC41	Q15345	812 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGSF3	O75054	1194 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGHA2	P01877	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	VCAM1	P19320	739 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691		E9PSI1	815 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	RARB	P10826	455 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCAM	P43121	646 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	COG2	Q14746	738 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF180	Q86T96	592 aa		13.68	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms