RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530346.5

GMDS-AS1-206, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 594 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SEPT2Q15019 361 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TRIM47Q96LD4 638 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CTGFP29279 349 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ARMC5Q96C12 935 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SRRDQ9UH36 339 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 APPP05067 770 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TDO2P48775 406 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NBPF11Q86T75 865 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ACER1Q8TDN7 264 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L15C9J2P7 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L11C9JVI0 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L18D6R9N7 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L22D6RA61 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L19D6RCP7 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L20D6RJB6 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 AKR1B1P15121 316 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 USP17L24Q0WX57 530 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.65■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.64■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SMIM22K7EJ46 135 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SH2D4AQ9H788 454 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HERVK_113P62684 666 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MYPNQ86TC9 1320 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 A0A1W2PRG0 241 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 VCAM1P19320 739 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ICA1Q05084 483 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NAPBQ9H115 298 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMX2Q9Y320 296 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SOX10P56693 466 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RAET1EQ8TD07 263 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LPAR1Q92633 364 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 COA7Q96BR5 231 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF333Q96JL9 665 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RASA1P20936 1047 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LBX2Q6XYB7 198 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RILPL2Q969X0 211 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PRKCZQ05513 592 aa21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PDE4BQ07343 736 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PPARAQ07869 468 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IRF5Q13568 498 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ALX1Q15699 326 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FAM227BQ96M60 508 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 VCPKMTQ9H867 229 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SDSP20132 328 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GRK4P32298 578 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FLT3LGP49771 235 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ERVK-9P63128 1117 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ERVK-24P63145 666 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 COG2Q14746 738 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GABRQQ9UN88 632 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 A0A0D9SFI3 127 aa21.56■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HIP1O00291 1037 aa21.56■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FOXP2O15409 715 aa21.56■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MAPK4P31152 587 aa21.56■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms