RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 NOVP48745 357 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 STK3Q13188 491 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CEP95Q96GE4 821 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 DDAH1O94760 285 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 TTLL1O95922 423 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 RRAGCQ9HB90 399 aa25.84■■□□□ 1.73
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ACER3-202ENST00000525194 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 SLURP2P0DP57 97 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 NECAB1Q8N987 351 aa25.83■■□□□ 1.73
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ACER3-202ENST00000525194 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 NF2P35240 595 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CAP2P40123 477 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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ACER3-202ENST00000525194 NYAP2Q9P242 653 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 NID2Q14112 1375 aa25.82■■□□□ 1.72
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ACER3-202ENST00000525194 GH2P01242 217 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 ASNSP08243 561 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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ACER3-202ENST00000525194 MICU3Q86XE3 530 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 PNMA1Q8ND90 353 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K14Q99558 947 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 ADM5C9JUS6 153 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CPLX1O14810 134 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 USP48Q86UV5 1035 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CDKL5O76039 1030 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 KIF5BP33176 963 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 ICA1Q05084 483 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 SEPT2Q15019 361 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 RTN1Q16799 776 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 LDHDQ86WU2 507 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 FANCBQ8NB91 859 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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ACER3-202ENST00000525194 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 TROAPQ12815 778 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 CDCA5Q96FF9 252 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 MYL10Q9BUA6 226 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 KIF3AQ9Y496 699 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-202ENST00000525194 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 GUCY1A2P33402 732 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 ATP2B2Q01814 1243 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 ST3GAL1Q11201 340 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 SH2D4AQ9H788 454 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 RXRAP19793 462 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 GNAQP50148 359 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.75■■□□□ 1.71
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ACER3-202ENST00000525194 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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ACER3-202ENST00000525194 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 KLRG1Q96E93 195 aa25.74■■□□□ 1.71
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ACER3-202ENST00000525194 PICK1Q9NRD5 415 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 GRM4Q14833 912 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-202ENST00000525194 UTRNP46939 3433 aa25.73■■□□□ 1.71
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