RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PCNT	O95613	3336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903		A0A1W2PP55	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	RARA	P10276	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NFKBIE	O00221	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	HMOX1	P09601	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CES1	P23141	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CABP4	P57796	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	FANCC	Q00597	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GRM2	Q14416	872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CEP120	Q8N960	986 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	BHMT	Q93088	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TCF12	Q99081	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PIK3R2	O00459	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GIPC1	O14908	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GYS1	P13807	737 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	YY1	P25490	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	POLD1	P28340	1107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TM4SF1	P30408	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NRL	P54845	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GPLD1	P80108	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C5	P01031	1676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KCNA3	P22001	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	COL8A1	P27658	744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CHD4	Q14839	1912 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	MRC1	P22897	1456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	GNB5	O14775	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	SIN3B	O75182	1162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	TRPA1	O75762	1119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	PSAP	P07602	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF19A-208	ENST00000520903	MMP10	P09238	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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