RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520023.1

EXTL3-AS1-203, EXTL3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EXTL3-AS1, Length 780 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CRBNQ96SW2 442 aa15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RNF208Q9H0X6 261 aa15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.93■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ALPK3Q96L96 1907 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 AKR1B1P15121 316 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 IRF5Q13568 498 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CERS3Q8IU89 383 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 C12orf42Q96LP6 360 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GINM1Q9NU53 330 aa15.92■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PARP14Q460N5 1801 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L12C9JPN9 530 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L21D6R901 530 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GJB1P08034 283 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 VCAM1P19320 739 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GJA8P48165 433 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 UBE3CQ15386 1083 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 OSBP2Q969R2 916 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 COA7Q96BR5 231 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FEZ1Q99689 392 aa15.91■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SLC34A2O95436 690 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CYP2B6P20813 491 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ERVK-9P63128 1117 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ERVK-24P63145 666 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 C12orf60Q5U649 245 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CTR9Q6PD62 1173 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TRIB2Q92519 343 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 BTBD7Q9P203 1132 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.9■□□□□ 0.14
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 M0R2C6 588 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CDK8P49336 464 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 UBXN2AP68543 259 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CCL14Q16627 93 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CABP5Q9NP86 173 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP6NLQ92738 828 aa15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 DEFB118Q96PH6 123 aa15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L15C9J2P7 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L11C9JVI0 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L18D6R9N7 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L22D6RA61 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L19D6RCP7 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L20D6RJB6 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SGPL1O95470 568 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP17L24Q0WX57 530 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GPR142Q7Z601 462 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.87■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 H0YGN5 161 aa15.86■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MORN1Q5T089 497 aa15.86■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.86■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.86■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.86■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 APPBP2Q92624 585 aa15.85■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GPAA1O43292 621 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 HMGCRP04035 888 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 USP14P54578 494 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.84■□□□□ 0.13
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SWAP70Q9UH65 585 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms