RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PQH9 124 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM170BA6NMN3 283 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLF4O43474 513 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 FURINP09958 794 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM87AP0C7U9 286 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAG1P15918 1043 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC6Q86TZ1 520 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDH24Q86UP0 819 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR19A6NJB7 356 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR64B1ANS9 1081 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNNI3KQ59H18 835 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM192Q8IY95 271 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXL6Q8N531 539 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXL18Q96ME1 805 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 MIPEPQ99797 713 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGB7P26010 798 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 GBP1P32455 592 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ETV3P41162 512 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOGA3Q5TF21 947 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBXN4Q92575 508 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF4Q96M43 638 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATG3Q9NT62 314 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP7A1P22680 504 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 OXCT1P55809 520 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB33AQ14088 237 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF141Q8WVD5 230 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLEC3AO75596 197 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOSL1P15407 271 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIR3DL1P43629 444 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP2R5EQ16537 467 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 BBS9Q3SYG4 887 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q96M66 194 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A18Q96N87 628 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASPNQ9BXN1 380 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIM2Q9P1W9 311 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 LEMD3Q9Y2U8 911 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 U3KQE9 123 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR33A8MZF0 331 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRN2O75325 713 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF4P78317 190 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERINC3Q13530 473 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 FXNQ16595 210 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms