RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 USP14P54578 494 aa21.31■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.31■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 PNMA3Q9UL41 463 aa21.31■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 FOXP2O15409 715 aa21.3■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 GUCY1A2P33402 732 aa21.3■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.3■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 FGAP02671 866 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 OSBPP22059 807 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 SP3Q02447 781 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ICA1Q05084 483 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 TREML2Q5T2D2 321 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 SH2D4AQ9H788 454 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ZMYM6O95789 1325 aa21.29■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 CYP2C8P10632 490 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 RASA1P20936 1047 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 CHMLP26374 656 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 TNS4Q8IZW8 715 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ACER1Q8TDN7 264 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ERO1AQ96HE7 468 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 RAD50Q92878 1312 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 PRDM1O75626 825 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 DGKZQ13574 1117 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 PTPRFP10586 1907 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 MYH8P13535 1937 aa21.27■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ATP2B2Q01814 1243 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF6Q15052 776 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 C12orf42Q96LP6 360 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CPA4Q9UI42 421 aa21.26■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TSPY3P0CV98 308 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TSPY8P0CW00 308 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 KIF22Q14807 665 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 C17orf99Q6UX52 265 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 SKAP1Q86WV1 359 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.25■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.24■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TOMM22Q9NS69 142 aa21.24■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 A0A1W2PRG0 241 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L15C9J2P7 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L11C9JVI0 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L18D6R9N7 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L22D6RA61 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L19D6RCP7 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L20D6RJB6 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF213O14771 459 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TFAP4Q01664 338 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L24Q0WX57 530 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TMX2Q9Y320 296 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 TSPY2A6NKD2 308 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 VCAM1P19320 739 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 HAND2P61296 217 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 LPAR1Q92633 364 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 GOPCQ9HD26 462 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 NYAP2Q9P242 653 aa21.22■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 SGSM2O43147 1006 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 ORC4O43929 436 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 BCRP11274 1271 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 VCPKMTQ9H867 229 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 EFCC1Q9HA90 598 aa21.21■□□□□ 0.99
FAAP20-215ENST00000514625 FGRP09769 529 aa21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 CASC1Q6TDU7 716 aa21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-215ENST00000514625 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms