RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HMGCS2P54868 508 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ICA1Q05084 483 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MAP4K1Q92918 833 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1W2PRG0 241 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BTBD19C9JJ37 291 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYP21A2P08686 494 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BACE1P56817 501 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FEZ1Q99689 392 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TOMM22Q9NS69 142 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF186Q9NXI6 227 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSKSQ9UJT2 592 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RLFQ13129 1914 aa15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP17L10C9JJH3 530 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSPY3P0CV98 308 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSPY8P0CW00 308 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 INHBEP58166 350 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TFAP4Q01664 338 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TREML2Q5T2D2 321 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FOXN1O15353 648 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NMT2O60551 498 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRPA1O75762 1119 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP2B2Q01814 1243 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CEP95Q96GE4 821 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.84■□□□□ 0.13
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSPY2A6NKD2 308 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 B4E1Z4 1266 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C19orf81C9J6K1 198 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PDHXO00330 501 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC27A2O14975 620 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CRHR2Q13324 411 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C12orf42Q96LP6 360 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CA12O43570 354 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KDM4AO75164 1064 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TBC1D8O95759 1140 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 VCAM1P19320 739 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NECTIN1Q15223 517 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ESR2Q92731 530 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NYAP2Q9P242 653 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMX2Q9Y320 296 aa15.81■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MGAMO43451 1857 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 E7EWF7 191 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ALDH1A1P00352 501 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYP2C8P10632 490 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP14P54578 494 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SH2D4AQ9H788 454 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 VCPKMTQ9H867 229 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 REC8O95072 547 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms