RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510920.5

FAM200B-217, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM200B, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-217ENST00000510920 CPA4Q9UI42 421 aa14.67□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 PNMA3Q9UL41 463 aa14.67□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.67□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 C19orf81C9J6K1 198 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 PDE4AP27815 886 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 CDK8P49336 464 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 KIF22Q14807 665 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 SEPT2Q15019 361 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 ARHGEF6Q15052 776 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 SBK1Q52WX2 424 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 TREML2Q5T2D2 321 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 FAM227BQ96M60 508 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 TRIM17Q9Y577 477 aa14.66□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 PTPRFP10586 1907 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 A0A0D9SFI3 127 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 SMIM22K7EJ46 135 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 OSBPP22059 807 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 TICAM2Q86XR7 235 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 ABHD8Q96I13 439 aa14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAM200B-217ENST00000510920 HIP1O00291 1037 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 AKR1B1P15121 316 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 SDSP20132 328 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP14P54578 494 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 TTC22Q5TAA0 569 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 IFFO2Q5TF58 517 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CCDC17Q96LX7 622 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 EFCC1Q9HA90 598 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 MYH8P13535 1937 aa14.64□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ATP2B2Q01814 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ICA1Q05084 483 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 C17orf99Q6UX52 265 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ACER1Q8TDN7 264 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.63□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 PRDM1O75626 825 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 GUCY1A2P33402 732 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 PDE4BQ07343 736 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 PPARAQ07869 468 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 VPS53Q5VIR6 699 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 SH2D4AQ9H788 454 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.62□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 RAD21O60216 631 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.61□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 VCAM1P19320 739 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 RASA1P20936 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 PSMC4P43686 418 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 C12orf42Q96LP6 360 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.6□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 A0A1W2PRG0 241 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L15C9J2P7 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L11C9JVI0 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L18D6R9N7 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L22D6RA61 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L19D6RCP7 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 USP17L20D6RJB6 530 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 TSPY3P0CV98 308 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 TSPY8P0CW00 308 aa14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAM200B-217ENST00000510920 BCRP11274 1271 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms