RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 SNAPC2Q13487 334 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 SPRYD7Q5W111 196 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CAPNS2Q96L46 248 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 NEK1Q96PY6 1258 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 WDR18Q9BV38 432 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 STX8Q9UNK0 236 aa13.11□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 TRIM75PA6NK02 468 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 C19orf81C9J6K1 198 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 IRF6O14896 467 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CETPP11597 493 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 INHBEP58166 350 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 ANAPC15P60006 121 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 SPP2Q13103 211 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 GOPCQ9HD26 462 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 NYAP2Q9P242 653 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 SEC24BO95487 1268 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 BACE1P56817 501 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 JAG1P78504 1218 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 HTRA3P83110 453 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 FGD1P98174 961 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 KCNB2Q92953 911 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CEP95Q96GE4 821 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 TTC14Q96N46 770 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 BACH2Q9BYV9 841 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 ZSWIM5Q9P217 1185 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.09□□□□□ -0.31
ITGA3-210ENST00000507771 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 PRC1O43663 620 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 RAD21O60216 631 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 GUCY1A2P33402 732 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 MAP2K2P36507 400 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 MTMR2Q13614 643 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 CCL15Q16663 113 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 DGKHQ86XP1 1220 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 RASEFQ8IZ41 740 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 MTA3Q9BTC8 594 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 KAT14Q9H8E8 782 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TACC3Q9Y6A5 838 aa13.08□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 VEGFBP49765 207 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 WTAPQ15007 396 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TMTC2Q8N394 836 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 LPAR1Q92633 364 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 MKL1Q969V6 931 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM87BQ96K49 555 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TMX2Q9Y320 296 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 TNKSO95271 1327 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 NMT2O60551 498 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 GJA5P36382 358 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 HMGCS2P54868 508 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-210ENST00000507771 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms