RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CYP2C8	P10632	490 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RASA1	P20936	1047 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PDE4B	Q07343	736 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ALX1	Q15699	326 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	IL25	Q9H293	177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	C19orf81	C9J6K1	198 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	FKTN	O75072	461 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ICA1	Q05084	483 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1W2PRG0	241 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RAD21	O60216	631 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TLR2	O60603	784 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	OSBP	P22059	807 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	USP14	P54578	494 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TFAP4	Q01664	338 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SP3	Q02447	781 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	RAD50	Q92878	1312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF213	O14771	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SGSM2	O43147	1006 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	PTH1R	Q03431	593 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CALD1-223	ENST00000496024	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	PEX10	O60683	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	VCAM1	P19320	739 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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