RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	PDE6A	P16499	860 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	PFAS	O15067	1338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	COA7	Q96BR5	231 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBMS1-215	ENST00000492283	MGAM	O43451	1857 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	HMGCR	P04035	888 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FLT1	P17948	1338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	COL6A1	P12109	1028 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIM32	Q13049	653 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	PTPRA	P18433	802 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MX1	P20591	662 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ADD2	P35612	726 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MBD4	O95243	580 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	CAP2	P40123	477 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	MYH1	P12882	1939 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ASNS	P08243	561 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SPP2	Q13103	211 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBMS1-215	ENST00000492283	IGHD	P01880	384 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	FOSL2	P15408	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIB2	Q92519	343 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PRKAB2	O43741	272 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GDF11	O95390	407 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	APP	P05067	770 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PDE1A	P54750	535 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2

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