RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 LILRB2Q8N423 598 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZS46 218 aa11.18□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 TMEM260Q9NX78 707 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRC-212ENST00000491302 MAP7Q14244 749 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRC-212ENST00000491302 SGSM3Q96HU1 749 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 TMX1Q9H3N1 280 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRC-212ENST00000491302 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.12□□□□□ -0.63
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PTPRC-212ENST00000491302 NOS3P29474 1203 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRC-212ENST00000491302 NFICP08651 508 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRE1Q14246 886 aa11.1□□□□□ -0.63
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PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 MIPEPQ99797 713 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS7Q99871 368 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 RXRBP28702 533 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 SQSTM1Q13501 440 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRC-212ENST00000491302 SV2CQ496J9 727 aa11.09□□□□□ -0.63
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