RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 BLIDQ8IZY5 108 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 CCDC17Q96LX7 622 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 IWS1Q96ST2 819 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 GNPTABQ3T906 1256 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 ADALQ6DHV7 355 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-213ENST00000489895 FANCCQ00597 558 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 GRIPAP1Q4V328 841 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MSL1Q68DK7 614 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SLC5A4Q9NY91 659 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.636e-6■□□□□ 10.8
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NISCH-213ENST00000489895 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 JAKMIP2Q96AA8 810 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 VAV2P52735 878 aa19.01■□□□□ 0.63
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 KIFC2Q96AC6 838 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 14.1
NISCH-213ENST00000489895 TAF12Q16514 161 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CSRNP2Q9H175 543 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 HARSP12081 509 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PHKA1P46020 1223 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MYCT1Q8N699 235 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NOX5Q96PH1 765 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ZNF521Q96K83 1311 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CALRP27797 417 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SDR42E1Q8WUS8 393 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 LIN9Q5TKA1 542 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 RBSNQ9H1K0 784 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NCAPD2Q15021 1401 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ASIC2Q16515 512 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SWAP70Q9UH65 585 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB2P05120 415 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MAP4K1Q92918 833 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PSTPIP2Q9H939 334 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.99■□□□□ 0.63
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NISCH-213ENST00000489895 GNA14O95837 355 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
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NISCH-213ENST00000489895 KLRF2D3W0D1 207 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SCG2P13521 617 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SLFN12Q8IYM2 578 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 RXRBP28702 533 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CALCOCO2Q13137 446 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CBX8Q9HC52 389 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 DOK7Q18PE1 504 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
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NISCH-213ENST00000489895 PRKG1Q13976 671 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 NLRP10Q86W26 655 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 ZNF75DP51815 510 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 TTC14Q96N46 770 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 DYMQ7RTS9 669 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 POLR2MP0CAP2 368 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 MCM6Q14566 821 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 FBXO11Q86XK2 927 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 RGS12O14924 1447 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-213ENST00000489895 CCDC14Q49A88 953 aa18.97■□□□□ 0.63
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