RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-211	ENST00000489495	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	AOX1	Q06278	1338 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CAND2	O75155	1236 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PHACTR2	O75167	634 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CDR1	P51861	262 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	DHX58	Q96C10	678 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	MTR	Q99707	1265 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PTPRT	O14522	1441 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	MYO1F	O00160	1098 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	FANCG	O15287	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC8A1	P32418	973 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PTK2	Q05397	1052 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	DRP2	Q13474	957 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SNCB	Q16143	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RNF34	Q969K3	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	MYO1B	O43795	1136 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	ZPR1	O75312	459 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RASSF9	O75901	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	LARGE1	O95461	756 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	S1PR4	O95977	384 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUBP1-211	ENST00000489495	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75

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