RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 RPTORQ8N122 1335 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 EVI5O60447 810 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 VCAM1P19320 739 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 MAPK4P31152 587 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR142Q7Z601 462 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PRO3102Q9H379 93 aa20.53■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 HMMRO75330 724 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 CNMDO75829 334 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 GUCY1A2P33402 732 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 GABPAQ06546 454 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE3AQ14432 1141 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 LCORLQ8N3X6 602 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L15C9J2P7 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L11C9JVI0 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L18D6R9N7 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L22D6RA61 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L19D6RCP7 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L20D6RJB6 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP14P54578 494 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L24Q0WX57 530 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 USP6NLQ92738 828 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CABP5Q9NP86 173 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 SEPT2Q15019 361 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CCL14Q16627 93 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MORN1Q5T089 497 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RLFQ13129 1914 aa20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RAB11FIP3O75154 756 aa20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP2D6P10635 497 aa20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RGS2P41220 211 aa20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 APBA2Q99767 749 aa20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ARMT1Q9H993 441 aa20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PRG0 241 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF3Q9H094 633 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 BTBD7Q9P203 1132 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 PARP14Q460N5 1801 aa20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKAB2O43741 272 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD4O95243 580 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CHGBP05060 677 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ADD2P35612 726 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNA1P78396 465 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP2K5Q13163 448 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR78Q5VTH9 848 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 LBX2Q6XYB7 198 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.46■□□□□ 0.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP5JP18859 108 aa20.45■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.45■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.45■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 STAP2Q9UGK3 403 aa20.45■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 PFASO15067 1338 aa20.45■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.44■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 HAUS7Q99871 368 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms