RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.08■■□□□ 1.77
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USP40-215ENST00000484528 TRIM32Q13049 653 aa26.07■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.07■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.07■■□□□ 1.76
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USP40-215ENST00000484528 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.06■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 C12orf42Q96LP6 360 aa26.06■■□□□ 1.76
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USP40-215ENST00000484528 USP17L15C9J2P7 530 aa26.04■■□□□ 1.76
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USP40-215ENST00000484528 USP17L11C9JVI0 530 aa26.04■■□□□ 1.76
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USP40-215ENST00000484528 USP17L24Q0WX57 530 aa26.04■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 TRIB2Q92519 343 aa26.04■■□□□ 1.76
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USP40-215ENST00000484528 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.03■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 MAPK4P31152 587 aa26.02■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.02■■□□□ 1.76
USP40-215ENST00000484528 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.01■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 SMIM22K7EJ46 135 aa26.01■■□□□ 1.75
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USP40-215ENST00000484528 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.01■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 GPR142Q7Z601 462 aa26.01■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.01■■□□□ 1.75
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USP40-215ENST00000484528 WDR78Q5VTH9 848 aa25.98■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.98■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.98■■□□□ 1.75
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USP40-215ENST00000484528 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 AKR1B1P15121 316 aa25.97■■□□□ 1.75
USP40-215ENST00000484528 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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USP40-215ENST00000484528 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.95■■□□□ 1.74
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USP40-215ENST00000484528 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
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