RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NAPBQ9H115 298 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-211ENST00000480301 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-211ENST00000480301 BCRP11274 1271 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 C12orf42Q96LP6 360 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRG0 241 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 RASA1P20936 1047 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 PNMA3Q9UL41 463 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 TRIM17Q9Y577 477 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 OSBPP22059 807 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 USP14P54578 494 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 PPARAQ07869 468 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 ALX1Q15699 326 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 FEZ1Q99689 392 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 EFCC1Q9HA90 598 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 HIP1O00291 1037 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 PRDM1O75626 825 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 CTGFP29279 349 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 ICA1Q05084 483 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 FGAP02671 866 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-211ENST00000480301 MYH8P13535 1937 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 KIF22Q14807 665 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 VCAM1P19320 739 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF6Q15052 776 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 TMX2Q9Y320 296 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L15C9J2P7 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L11C9JVI0 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L18D6R9N7 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L22D6RA61 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L19D6RCP7 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L20D6RJB6 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 PDE4BQ07343 736 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 USP17L24Q0WX57 530 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 TRIM47Q96LD4 638 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.583e-23■■□□□ 14.2
ACTB-211ENST00000480301 ZMYM6O95789 1325 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CAPN15O75808 1086 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 NEFLP07196 543 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 PSMC4P43686 418 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 HERVK_113P62684 666 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 SKAP1Q86WV1 359 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 IL25Q9H293 177 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 INCENPQ9NQS7 918 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 SH2D4AQ9H788 454 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 VCPKMTQ9H867 229 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 GNRH1P01148 92 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ATP2B2Q01814 1243 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTB-211ENST00000480301 FGRP09769 529 aa24.89■■□□□ 1.58
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