RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.01□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 IFT57Q9NWB7 429 aa15.01□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 TBX21Q9UL17 535 aa15.01□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 A0A1W2PQY0 241 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 RFXAPO00287 272 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 TBC1D12O60347 775 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 CNMDO75829 334 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 CAP2P40123 477 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 RABGGTBP53611 331 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 BACE1P56817 501 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 GJD3Q8N144 294 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 AS3MTQ9HBK9 375 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 CACNA1HO95180 2353 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 ZNF521Q96K83 1311 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 MYOGP15173 224 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 CCNA1P78396 465 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 METTL24Q5JXM2 366 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 TOX2Q96NM4 488 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 WDR18Q9BV38 432 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 APBB1O00213 710 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 ALADP13716 330 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 GNAI1P63096 354 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 GBF1Q92538 1859 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 FLIIQ13045 1269 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 LRRC24Q50LG9 513 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 RUNDC1Q96C34 613 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 GAKO14976 1311 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 KIF16BQ96L93 1317 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 EPOPA6NHQ4 379 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 PDE8BO95263 885 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 PGK1P00558 417 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 SLC4A2P04920 1241 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 SLC5A1P13866 664 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 TMEM199Q8N511 208 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-208ENST00000480104 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.95□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 DPP9Q86TI2 863 aa14.95□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 CERS4Q9HA82 394 aa14.95□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 DCXO43602 365 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 GFRA3O60609 400 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 ADORA2AP29274 412 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 RNF180Q86T96 592 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 PRSS33Q8NF86 280 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 IL23AQ9NPF7 189 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.94□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 C19orf81C9J6K1 198 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 USP17L10C9JJH3 530 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 GRM8O00222 908 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 RARBP10826 455 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 FGFR2P21802 821 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 BTDP43251 543 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 JAG1P78504 1218 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 BTBD7Q9P203 1132 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 DMDP11532 3685 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 FGBP02675 491 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 ASNSP08243 561 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 CYP2C18P33260 490 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 BEND3Q5T5X7 828 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.91□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.9□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 F6X3S4 739 aa14.9□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 COBLO75128 1261 aa14.9□□□□□ -0.02
USP11-208ENST00000480104 CA3P07451 260 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms