RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 BRCA2P51587 3418 aa25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 A0A1W2PRG0 241 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 A0A0D9SFI3 127 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 FAM227BQ96M60 508 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 PSMC4P43686 418 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 KIF22Q14807 665 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 ARHGEF6Q15052 776 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 CCDC17Q96LX7 622 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 FEZ1Q99689 392 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 MYH8P13535 1937 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 GNRH1P01148 92 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 VCAM1P19320 739 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 RASA1P20936 1047 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 OSBPP22059 807 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 TDO2P48775 406 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 USP14P54578 494 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-208ENST00000475335 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 VPS53Q5VIR6 699 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 APPP05067 770 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 HERVK_113P62684 666 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 ICA1Q05084 483 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 ARMC5Q96C12 935 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 SRRDQ9UH36 339 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 PRMT2P55345 433 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 FCGRTP55899 365 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 RILPL2Q969X0 211 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 NAPBQ9H115 298 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 TMX2Q9Y320 296 aa25.1■■□□□ 1.61
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SIKE1-208ENST00000475335 RGS19P49795 217 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L15C9J2P7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L11C9JVI0 530 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L18D6R9N7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L22D6RA61 530 aa25.08■■□□□ 1.61
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SIKE1-208ENST00000475335 USP17L19D6RCP7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-208ENST00000475335 USP17L20D6RJB6 530 aa25.08■■□□□ 1.61
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SIKE1-208ENST00000475335 USP17L24Q0WX57 530 aa25.08■■□□□ 1.61
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SIKE1-208ENST00000475335 ZNF333Q96JL9 665 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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SIKE1-208ENST00000475335 TTC22Q5TAA0 569 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 LBX2Q6XYB7 198 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 VCPKMTQ9H867 229 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 GABRQQ9UN88 632 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 ZMYM6O95789 1325 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-208ENST00000475335 HOXD10P28358 340 aa25.05■■□□□ 1.6
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