RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 CD320Q9NPF0 282 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 MED14OSP0DP75 135 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 HK2P52789 917 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 GAB4Q2WGN9 574 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 SRFP11831 508 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 MAP3K11Q16584 847 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 CREG2Q8IUH2 290 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 MYLIPQ8WY64 445 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 AK5Q9Y6K8 562 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-202ENST00000473460 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 RAC2P15153 192 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 KCNA10Q16322 511 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TMEM253P0C7T8 217 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 GLDCP23378 1020 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 ETV3P41162 512 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 KCNA1Q09470 495 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 LILRA6Q6PI73 481 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 RNF32Q9H0A6 362 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 LMNB1P20700 586 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PDE4BQ07343 736 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 DUSP13Q9UII6 198 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 LRRN2O75325 713 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 EGR3Q06889 387 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PHC3Q8NDX5 983 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 KCNN1Q92952 543 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 EBF1Q9UH73 591 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PLCG1P19174 1290 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 LINC00310P59036 64 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 FAM13CQ8NE31 585 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-202ENST00000473460 NCANO14594 1321 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 FAM221AA4D161 298 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CILPO75339 1184 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 INHBBP09529 407 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CTSHP09668 335 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 NR0B2Q15466 257 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 LILRA2Q8N149 483 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 RNF141Q8WVD5 230 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 SHISA3A0PJX4 238 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 F6X3S4 739 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PRRG2O14669 202 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 RLBP1P12271 317 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 FITM1A5D6W6 292 aa6.37□□□□□ -1.39
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