RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467859.3

PDE4DIP-210, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 1,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-210ENST00000467859 ATG3Q9NT62 314 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4DIP-210ENST00000467859 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4DIP-210ENST00000467859 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4DIP-210ENST00000467859 PIK3C2AO00443 1686 aa7.52□□□□□ -1.2
PDE4DIP-210ENST00000467859 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 OPLAHO14841 1288 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 PIP5K1CO60331 668 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TRIM27P14373 513 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 IGFBP4P22692 258 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 APOBRQ0VD83 1088 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 DDR2Q16832 855 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 GJD3Q8N144 294 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 UBR7Q8N806 425 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 LY75O60449 1722 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 M0R2N6 131 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MSL1Q68DK7 614 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 LYPD8Q6UX82 237 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SCLT1Q96NL6 688 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ST7Q9NRC1 585 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 USP6P35125 1406 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ABCC6O95255 1503 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 E2F8A0AVK6 867 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 C3orf80F5H4A9 247 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 GCP02774 474 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TNNI3KQ59H18 835 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ARMC3Q5W041 872 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 DESI1Q6ICB0 168 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NIM1KQ8IY84 436 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 HOOK2Q96ED9 719 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 STIM2Q9P246 746 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 IPPQ9Y573 584 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 A0A087X0B3 334 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ORC4O43929 436 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 PDE8AO60658 829 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NBNO60934 754 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MTA2O94776 668 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SERPINB3P29508 390 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ATICP31939 592 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 BCAMP50895 628 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 FSTL1Q12841 308 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ORC1Q13415 861 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MTERF2Q49AM1 385 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SKAP1Q86WV1 359 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 NINJ1Q92982 152 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SERINC2Q96SA4 455 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.214e-7■□□□□ 9.6
PDE4DIP-210ENST00000467859 OBP2AQ9NY56 170 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 POGKQ9P215 609 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 POLIQ9UNA4 740 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TMF1P82094 1093 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 TAF11Q15544 211 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 ERFEQ4G0M1 354 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 RNF180Q86T96 592 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4DIP-210ENST00000467859 RETREG3Q86VR2 466 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms