RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MYH1	P12882	1939 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CYP7A1	P22680	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ADD2	P35612	726 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		10.12	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	FLT1	P17948	1338 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	FECH	P22830	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	INHBE	P58166	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NUCB1	Q02818	461 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TCP10	Q12799	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.11	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DGAT1	O75907	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	VGLL4	Q14135	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	EHD4	Q9H223	541 aa		10.1	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	AOC2	O75106	756 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NR1I2	O75469	434 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	IGHD	P01880	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TM4SF4	P48230	202 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PDE1A	P54750	535 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PICALM	Q13492	652 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PTPRF	P10586	1907 aa		10.09	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	FAM187A	A6NFU0	413 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	GPR37	O15354	613 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	PPAT	Q06203	517 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	PPIL2	Q13356	520 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	PRKG1	Q13976	671 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	APPBP2	Q92624	585 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
USP34-208	ENST00000467128	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms