RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRU-206ENST00000465525 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRU-206ENST00000465525 KAT14Q9H8E8 782 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRU-206ENST00000465525 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRU-206ENST00000465525 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-206ENST00000465525 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTPRU-206ENST00000465525 TTLL1O95922 423 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 PNMA1Q8ND90 353 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 ANKS1AQ92625 1134 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 GINM1Q9NU53 330 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 ZBTB43O43298 467 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 SCRN1Q12765 414 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.13■□□□□ 0.81
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