RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 SHISA4Q96DD7 197 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 KCNQ2O43526 872 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF18P17022 549 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA20Q8TB22 786 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 FERMT2Q96AC1 680 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 DNAI1Q9UI46 699 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 CACNA1SQ13698 1873 aa20.89■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA3EO15041 775 aa20.89■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 PLCD1P51178 756 aa20.89■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 EPSTI1Q96J88 318 aa20.89■□□□□ 0.94
SYNE4-204ENST00000465425 MYH6P13533 1939 aa20.89■□□□□ 0.94
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SYNE4-204ENST00000465425 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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SYNE4-204ENST00000465425 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SLFN14P0C7P3 912 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF384Q8TF68 577 aa20.88■□□□□ 0.93
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SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.88■□□□□ 0.93
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SYNE4-204ENST00000465425 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NPHP1O15259 732 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 STX10O60499 249 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF174Q15697 407 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC93Q567U6 631 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 A0A087X0B3 334 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TTC38Q5R3I4 469 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM139Q8IV31 216 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ORC4O43929 436 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 BARGINQ6ZT62 677 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 PAGE5Q96GU1 130 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP3Q96P20 1036 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 KLRK1P26718 216 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NYXQ9GZU5 481 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TSPY2A6NKD2 308 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NMT2O60551 498 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP5P59047 1200 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TC2NQ8N9U0 490 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 GSDMAQ96QA5 445 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TAF1P21675 1872 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 PTGDRQ13258 359 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 MED15Q96RN5 788 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SCN7AQ01118 1682 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 NRAPQ86VF7 1730 aa20.84■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 WNT7AO00755 349 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SCG2P13521 617 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 PRDX5P30044 214 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 KCNQ4P56696 695 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA1Q5VX52 437 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF25Q93038 417 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GUL6 1792 aa20.83■□□□□ 0.93
SYNE4-204ENST00000465425 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
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