RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 MOGSQ13724 837 aa24.45■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 RAD50Q92878 1312 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 NT5C2P49902 561 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ICA1Q05084 483 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 CASC1Q6TDU7 716 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ZMYM6O95789 1325 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 FGAP02671 866 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 AKR1B1P15121 316 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 JAG1P78504 1218 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ZNF213O14771 459 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GNRH1P01148 92 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 TSPY3P0CV98 308 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 TSPY8P0CW00 308 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 DGKZQ13574 1117 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 LPAR1Q92633 364 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 C12orf42Q96LP6 360 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L15C9J2P7 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L11C9JVI0 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L18D6R9N7 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L22D6RA61 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L19D6RCP7 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L20D6RJB6 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 HOXD10P28358 340 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ATP2B2Q01814 1243 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 USP17L24Q0WX57 530 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 VPS53Q5VIR6 699 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 C17orf99Q6UX52 265 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GOPCQ9HD26 462 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 CYP2C8P10632 490 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 RASA1P20936 1047 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 GUCY1A2P33402 732 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 EVX2Q03828 476 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 EFCC1Q9HA90 598 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 TOMM22Q9NS69 142 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-209ENST00000462357 TSPY2A6NKD2 308 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CHMLP26374 656 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 TREML2Q5T2D2 321 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CPA4Q9UI42 421 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 TMX2Q9Y320 296 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 SIPA1L1O43166 1804 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 ACER1Q8TDN7 264 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 NYAP2Q9P242 653 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 LAMB1P07942 1786 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 PRDM1O75626 825 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 TFAP4Q01664 338 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 TRIM17Q9Y577 477 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 ORC4O43929 436 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 TTLL1O95922 423 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 PRMT2P55345 433 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 VCPKMTQ9H867 229 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 VCAM1P19320 739 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 FCGRTP55899 365 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 SMIM22K7EJ46 135 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 FOXP2O15409 715 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 RAD21O60216 631 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 ESR2Q92731 530 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PRG0 241 aa24.33■■□□□ 1.49
IMP4-209ENST00000462357 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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