RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 MECOMQ03112 1051 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 AFMP43652 599 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ELF2Q15723 593 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 FEZ1Q99689 392 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CACNA1SQ13698 1873 aa23.37■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 A0A087X0B3 334 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 NMT2O60551 498 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ZNF18P17022 549 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 FGRP09769 529 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 WNT7AO00755 349 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DDAH1O94760 285 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TUBB4AP04350 444 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ZNF174Q15697 407 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SPATA20Q8TB22 786 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DNAI1Q9UI46 699 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 NPHP1O15259 732 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 PLCD1P51178 756 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 MED15Q96RN5 788 aa23.35■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SEMA3EO15041 775 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TAF1P21675 1872 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SLFN14P0C7P3 912 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 BARGINQ6ZT62 677 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP6O43182 974 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CASP1P29466 404 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 PRDX5P30044 214 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TMEM139Q8IV31 216 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 FERMT2Q96AC1 680 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 BMP15O95972 392 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TTC38Q5R3I4 469 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 PAGE5Q96GU1 130 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NLRP3Q96P20 1036 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 JAG2Q9Y219 1238 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 CYP2D6P10635 497 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 OGFRQ9NZT2 677 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NRAPQ86VF7 1730 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN12O43309 604 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NPY5RQ15761 445 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 CCDC93Q567U6 631 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TNFRSF25Q93038 417 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ORC4O43929 436 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SETDB2Q96T68 719 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TSPY2A6NKD2 308 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NLRP5P59047 1200 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 PTGDRQ13258 359 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TC2NQ8N9U0 490 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 16
IMP4-208ENST00000460766 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 STX17P56962 302 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NYXQ9GZU5 481 aa23.3■■□□□ 1.32
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