RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NOVP48745 357 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K10Q02779 954 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TEPSINQ96N21 525 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STX8Q9UNK0 236 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CPLX1O14810 134 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLURP2P0DP57 97 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GJB2P29033 226 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EPHX2P34913 555 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RTN1Q16799 776 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP95Q96GE4 821 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYL10Q9BUA6 226 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CABP5Q9NP86 173 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDKL5O76039 1030 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RXRAP19793 462 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FANCBQ8NB91 859 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNMA1Q8ND90 353 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATAD5Q96QE3 1844 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYH6P13533 1939 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CTDNEP1O95476 244 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTLL1O95922 423 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUCB2P80303 420 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TROAPQ12815 778 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCAF15Q66K64 600 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K14Q99558 947 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF3AQ9Y496 699 aa17.73■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 JAK2O60674 1132 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GDF11O95390 407 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC27P30260 824 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF5BP33176 963 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADD1P35611 737 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NYAP2Q9P242 653 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.72■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GH2P01242 217 aa17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDCP20941 246 aa17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SULF1Q8IWU6 871 aa17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.71■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFNAR1P17181 557 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GUCY1A2P33402 732 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAP2P40123 477 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GRM4Q14833 912 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEPT2Q15019 361 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NTRK3Q16288 839 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX11Q96FC9 970 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GINM1Q9NU53 330 aa17.7■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POTECB2RU33 542 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GNAQP50148 359 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ICA1Q05084 483 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MKL1Q969V6 931 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DOCK1Q14185 1865 aa17.69■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DTNBO60941 627 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASNSP08243 561 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYT1P21579 422 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 JAG1P78504 1218 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP2B2Q01814 1243 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.68■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms