RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKR1B1P15121 316 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HOXD10P28358 340 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FLT3LGP49771 235 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HERVK_113P62684 666 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C12orf60Q5U649 245 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NBPF11Q86T75 865 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FEZ1Q99689 392 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH4Q9Y623 1939 aa17.39■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ELNP15502 786 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTR9Q6PD62 1173 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MX1P20591 662 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APPBP2Q92624 585 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SHISA4Q96DD7 197 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CABP5Q9NP86 173 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GSG1L2A8MUP6 293 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNMDO75829 334 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VCAM1P19320 739 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDK8P49336 464 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q3C1V9 767 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD45Q5TZF3 282 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADCY3O60266 1144 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SWAP70Q9UH65 585 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPAA1O43292 621 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PORCNQ9H237 461 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GJD2Q9UKL4 321 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCL5P13501 91 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IRF5Q13568 498 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STK11IPQ8N1F8 1099 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L15C9J2P7 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L11C9JVI0 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L18D6R9N7 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L22D6RA61 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L19D6RCP7 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L20D6RJB6 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERC2O15083 957 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INHAP05111 366 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP14P54578 494 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERVK-9P63128 1117 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERVK-24P63145 666 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L24Q0WX57 530 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COA7Q96BR5 231 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGHDP01880 384 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM32Q13049 653 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCC1Q96CN9 775 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FSD1Q9BTV5 496 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALPK3Q96L96 1907 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FRMPD3Q5JV73 1810 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ICA1Q05084 483 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SBK1Q52WX2 424 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BTBD7Q9P203 1132 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STAP2Q9UGK3 403 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FOXP2O15409 715 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE1AP54750 535 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LNPKQ9C0E8 428 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF208Q9H0X6 261 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RASA1P20936 1047 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBXN2AP68543 259 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms