RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 RFPL1O75677 317 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 RAG1P15918 1043 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CD33P20138 364 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CABP4P57796 275 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NSMFQ6X4W1 530 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC1Q99614 292 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFLR1Q9H665 355 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT82Q9NSB4 513 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL3Q9UH77 587 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 HCN2Q9UL51 889 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC189A1A4V9 331 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PRODHO43272 600 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 OPA1O60313 960 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCAB14O75071 495 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ASLP04424 464 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC27P30260 824 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM182BQ5T319 152 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DGKHQ86XP1 1220 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 USP7Q93009 1102 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP11A1P05108 521 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PGRP06401 933 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGAVP06756 1048 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FLT3P36888 993 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GSTM4Q03013 218 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 BRAPQ7Z569 592 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTD1Q8N815 330 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SCYL1Q96KG9 808 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CORO1BQ9BR76 489 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 MTFR1LQ9H019 292 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRDO14764 452 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ZEB2O60315 1214 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GFRA3O60609 400 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ABLIM3O94929 683 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CPB1P15086 417 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GABREP78334 506 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR20EP86478 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR20CP86479 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR20DP86480 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR20BP86481 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR20AP86496 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS15P98073 1019 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM35AQ86V20 835 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBP2Q969R2 916 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 HAUS7Q99871 368 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms