RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.44■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 SWAP70Q9UH65 585 aa17.44■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 MYH1P12882 1939 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ERVK-9P63128 1117 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ERVK-24P63145 666 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 LBX2Q6XYB7 198 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 DCTPP1Q9H773 170 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 GUCY1A2P33402 732 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 DEFB118Q96PH6 123 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ARMT1Q9H993 441 aa17.42■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 MBD4O95243 580 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 VCAM1P19320 739 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 SEPT2Q15019 361 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 Q3C1V9 767 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ACER1Q8TDN7 264 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 BCL11AQ9H165 835 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 RPTORQ8N122 1335 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 TFRCP02786 760 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 CCNA1P78396 465 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 AAMPQ13685 434 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 USP6NLQ92738 828 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 CCDC17Q96LX7 622 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.4■□□□□ 0.38
TNS1-208ENST00000439083 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 H0YGN5 161 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PRKAB2O43741 272 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 C12orf60Q5U649 245 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 GPR142Q7Z601 462 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ANKLE1Q8NAG6 615 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 DPF3Q92784 378 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 GPATCH3Q96I76 525 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PORCNQ9H237 461 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PEX10O60683 326 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CYP2B6P20813 491 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 RGS2P41220 211 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 MORN1Q5T089 497 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 TRIB2Q92519 343 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.38■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 A0A1W2PRG0 241 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 USP17L12C9JPN9 530 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 USP17L21D6R901 530 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CNMDO75829 334 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CYP2D6P10635 497 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 EVX2Q03828 476 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 COG2Q14746 738 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 KBTBD3Q8NAB2 608 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 LPAR1Q92633 364 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SH2D4AQ9H788 454 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CDK8P49336 464 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 APBA2Q99767 749 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 TMX2Q9Y320 296 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.36■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 TRIM32Q13049 653 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 MAP2K5Q13163 448 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms