RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf172-201ENST00000436881 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
C9orf172-201ENST00000436881 DYDC1Q8WWB3 177 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf172-201ENST00000436881 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf172-201ENST00000436881 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.02■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 B4DLN1 442 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 MCM6Q14566 821 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 FAM182BQ5T319 152 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 DDAH1O94760 285 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PI16Q6UXB8 463 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 BLIDQ8IZY5 108 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 M0R2C6 588 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SCG2P13521 617 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PNOCQ13519 176 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TEKT1Q969V4 418 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SLC39A14Q15043 492 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 STAMQ92783 540 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TTC14Q96N46 770 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CTNNA2P26232 953 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 RCOR1Q9UKL0 485 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 ADGRB1O14514 1584 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SMCO2A6NFE2 343 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 KRT9P35527 623 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CABP7Q86V35 215 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TMTC1Q8IUR5 882 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TRIML1Q8N9V2 468 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 NUP58Q9BVL2 599 aa18■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CETN3O15182 167 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 MYZAPP0CAP1 466 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CALCRLQ16602 461 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 USP40Q9NVE5 1235 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD62A6NC57 917 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC8AQ8IWT6 810 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 STK24Q9Y6E0 443 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CYP26C1Q6V0L0 522 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 REREQ9P2R6 1566 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 GALNT17Q6IS24 598 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 KRBA2Q6ZNG9 492 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 HOOK3Q86VS8 718 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TCHPQ9BT92 498 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 SPTLC3Q9NUV7 552 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PTPRUQ92729 1446 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 KLRF2D3W0D1 207 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PHACTR2O75167 634 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 NDUFA8P51970 172 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 MAATS1Q7Z4T9 603 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 PDE6BP35913 854 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CLIC4Q9Y696 253 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TCP10Q12799 353 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 IL25Q9H293 177 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CRB1P82279 1406 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 A0A087WWV3 80 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TUBB2AQ13885 445 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TUBB2BQ9BVA1 445 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 XDHP47989 1333 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 HSF2BPO75031 334 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TSGA10Q9BZW7 698 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 LMAN1P49257 510 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 EPB41P11171 864 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 IFNAR1P17181 557 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 VWA3BQ502W6 1294 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 LIFRP42702 1097 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms