RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRP6	O75581	1613 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNM1L	O00429	736 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHL1	O00533	1208 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MEGF6	O75095	1541 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC24C	P53992	1094 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DRP2	Q13474	957 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRB1	P82279	1406 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPA1L	P34931	641 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMS19	Q96T76	1030 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GUCY1A3	Q02108	690 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MGRN1	O60291	552 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FES	P07332	822 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP4	Q13107	963 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OPA1	O60313	960 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK38	Q15208	465 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP14	Q86W24	1093 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERICH2	A1L162	156 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AHCYL1	O43865	530 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE4B	Q07343	736 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTGIS	Q16647	500 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZUG5	572 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENC1	O14682	589 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECEL1	O95672	775 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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