RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.85■■■□□ 2.37
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1W2PRG0 241 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.84■■■□□ 2.37
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAPBQ9H115 298 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM17Q9Y577 477 aa29.84■■■□□ 2.37
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FEZ1Q99689 392 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTGFP29279 349 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNMA3Q9UL41 463 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.8■■■□□ 2.36
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ICA1Q05084 483 aa29.78■■■□□ 2.36
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SKAP1Q86WV1 359 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.77■■■□□ 2.36
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.74■■■□□ 2.35
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.73■■■□□ 2.35
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZMYM6O95789 1325 aa29.72■■■□□ 2.35
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP2B2Q01814 1243 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VCPKMTQ9H867 229 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNRH1P01148 92 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH2D4AQ9H788 454 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.7■■■□□ 2.35
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