RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCN6P51797 869 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 NFIXQ14938 502 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 USP49Q70CQ1 688 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ST7Q9NRC1 585 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN12O43309 604 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 MNS1Q8NEH6 495 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 DEXIO95424 95 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 UBXN4Q92575 508 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 CABP5Q9NP86 173 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD6Q9BX69 1037 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN7AQ01118 1682 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 MLKLQ8NB16 471 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCF2Q9UG63 623 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 MORC3Q14149 939 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TERF2Q15554 542 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 PROM2Q8N271 834 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCBQ8NB91 859 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CSRNP2Q9H175 543 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 LY75O60449 1722 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF18P17022 549 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TC2NQ8N9U0 490 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 MED15Q96RN5 788 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 NID2Q14112 1375 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP3Q96P20 1036 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 DACH1Q9UI36 760 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP5O75197 1615 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMB2P55268 1798 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM205CA6NFA0 338 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAT2P19087 354 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM22K7EJ46 135 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG11P61952 73 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR24Q96S15 920 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 PPARAQ07869 468 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 DOCK2Q92608 1830 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TADA3O75528 432 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TMTC2Q8N394 836 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX58Q96C10 678 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 DESI2Q9BSY9 194 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 STX10O60499 249 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 RAI14Q9P0K7 980 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CASQ1P31415 396 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 AFMP43652 599 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA4Q96DD7 197 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 EPC1Q9H2F5 836 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP7A1P22680 504 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 CASP1P29466 404 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 EPSTI1Q96J88 318 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TNKSO95271 1327 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNRD1Q16881 649 aa21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms