RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415919.2

PRAMEF9-201, Transcript of PRAME family member 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF9, Length 1,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9-201ENST00000415919 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 ANKS1AQ92625 1134 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 CCDC17Q96LX7 622 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9-201ENST00000415919 SBF1O95248 1867 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TNFAIP1Q13829 316 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PPP2R5BQ15173 497 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PNMA1Q8ND90 353 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CEP95Q96GE4 821 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 DNAJC18Q9H819 358 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 NID2Q14112 1375 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 H3BQV1 296 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GRIN3BO60391 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FOSBP53539 338 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 NFKBIBQ15653 356 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 IFFO2Q5TF58 517 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GBP4Q96PP9 640 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 HACL1Q9UJ83 578 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SOCS7O14512 581 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 EPS15P42566 896 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TROAPQ12815 778 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 RASA3Q14644 834 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PHKBQ93100 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MTMR7Q9Y216 660 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 NBR1Q14596 966 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MTMR6Q9Y217 621 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 IFNAR1P17181 557 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 KIF5BP33176 963 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ATP2B2Q01814 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 NTRK3Q16288 839 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GDF11O95390 407 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TTLL1O95922 423 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CABP5Q9NP86 173 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SIPA1L1O43166 1804 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MYH8P13535 1937 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 F13A1P00488 732 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 C8orf76Q96K31 380 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MAP3K14Q99558 947 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ALG1Q9BT22 464 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 NOVP48745 357 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 WASF1Q92558 559 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TBC1D12O60347 775 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 MCM4P33991 863 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GUCY1B3Q02153 619 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GRM4Q14833 912 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 SEPT2Q15019 361 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 STK36Q9NRP7 1315 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF9-201ENST00000415919 GH2P01242 217 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF9-201ENST00000415919 GNAQP50148 359 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms