RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 BCRP11274 1271 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 MGAMO43451 1857 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 CTGFP29279 349 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 NAPBQ9H115 298 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 EFCC1Q9HA90 598 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 SDSP20132 328 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 PNMA3Q9UL41 463 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 A0A1W2PRG0 241 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 TTC22Q5TAA0 569 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 RASA1P20936 1047 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 OSBPP22059 807 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.252e-7■■■■□ 20.5
PTPA-210ENST00000414510 C12orf42Q96LP6 360 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 CCDC17Q96LX7 622 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PRDM1O75626 825 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 ICA1Q05084 483 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 KIF22Q14807 665 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PPARAQ07869 468 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 TICAM2Q86XR7 235 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 VCAM1P19320 739 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PSMC4P43686 418 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 USP14P54578 494 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PEX10O60683 326 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 TRIM47Q96LD4 638 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 SKAP1Q86WV1 359 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 ATP2B2Q01814 1243 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPA-210ENST00000414510 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 HERVK_113P62684 666 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF6Q15052 776 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 MYH4Q9Y623 1939 aa29■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 IL25Q9H293 177 aa29■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 KANSL2Q9H9L4 492 aa29■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 INCENPQ9NQS7 918 aa29■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L15C9J2P7 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L11C9JVI0 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L18D6R9N7 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L22D6RA61 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L19D6RCP7 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L20D6RJB6 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 FGAP02671 866 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 USP17L24Q0WX57 530 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 ALX1Q15699 326 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 TMX2Q9Y320 296 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 LAMA4Q16363 1823 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 HIP1O00291 1037 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 FCGRTP55899 365 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 PDE4BQ07343 736 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 PARP14Q460N5 1801 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 RLFQ13129 1914 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 VCPKMTQ9H867 229 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPA-210ENST00000414510 SRRDQ9UH36 339 aa28.97■■■□□ 2.23
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