RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 ACER1Q8TDN7 264 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L15C9J2P7 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L11C9JVI0 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L18D6R9N7 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L22D6RA61 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L19D6RCP7 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L20D6RJB6 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 ADCY3O60266 1144 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 USP17L24Q0WX57 530 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 C12orf42Q96LP6 360 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 FSD1Q9BTV5 496 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 GUCY1A2P33402 732 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 CDK8P49336 464 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 CTR9Q6PD62 1173 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 OSBP2Q969R2 916 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC17Q96LX7 622 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 APPP05067 770 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 GNAT2P19087 354 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54-204ENST00000411961 IRF5Q13568 498 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 GPAA1O43292 621 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 VCAM1P19320 739 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 MTFR1Q15390 333 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 SH2D4AQ9H788 454 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 CCL5P13501 91 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 AKR1B1P15121 316 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ELNP15502 786 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 TDO2P48775 406 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 SBK1Q52WX2 424 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 RNF208Q9H0X6 261 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 M0R2C6 588 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 MAPK4P31152 587 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ERVK-9P63128 1117 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ERVK-24P63145 666 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ICA1Q05084 483 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 HTTP42858 3142 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 A0A1W2PRG0 241 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 SMIM22K7EJ46 135 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 PEX10O60683 326 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 CCNA1P78396 465 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 ATP2B2Q01814 1243 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 INHAP05111 366 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 Q3C1V9 767 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 STAP2Q9UGK3 403 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 PDE1AP54750 535 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 EVI5LQ96CN4 794 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 LNPKQ9C0E8 428 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 GJD2Q9UKL4 321 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 TMX2Q9Y320 296 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 GJB1P08034 283 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 COG2Q14746 738 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 LPAR1Q92633 364 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms