RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DESP17661 470 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CABP7Q86V35 215 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 BRD3Q15059 726 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CFAP58Q5T655 872 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC174Q6PII3 467 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PGBD1Q96JS3 809 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM13AO94988 1023 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PI16Q6UXB8 463 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNJ18B7U540 433 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GYG1P46976 350 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNJ12Q14500 433 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DDIT3P35638 169 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 MORC3Q14149 939 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 NBPF14Q5TI25 921 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SARM1Q6SZW1 724 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 BLIDQ8IZY5 108 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CNBD1Q8NA66 436 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 UFL1O94874 794 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SCG2P13521 617 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 VWA3BQ502W6 1294 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DLC1Q96QB1 1528 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 MAGEA1P43355 309 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 USP37Q86T82 979 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 GSDMAQ96QA5 445 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 DDAH1O94760 285 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CHRNDQ07001 517 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 C8orf74Q6P047 294 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 CSRNP2Q9H175 543 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM94Q12767 1356 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 H7C1D1 291 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 IFNAR1P17181 557 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PTGDRQ13258 359 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 NOX5Q96PH1 765 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 C8orf37Q96NL8 207 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 RIMBP2O15034 1052 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 IQCDQ96DY2 449 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 ZEB2O60315 1214 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 ADCY7P51828 1080 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 CETN3O15182 167 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 DYMQ7RTS9 669 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 ADGRB1O14514 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 CALCRLQ16602 461 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 MMP1P03956 469 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 LIFRP42702 1097 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRN2-201ENST00000389413 DNM2P50570 870 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms