RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2D4AQ9H788 454 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMB1P07942 1786 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM22K7EJ46 135 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SKAP1Q86WV1 359 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMA3Q9UL41 463 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.27■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.27■□□□□ 0.52
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PGGT1B-202ENST00000379615 ICA1Q05084 483 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CRHR2Q13324 411 aa18.26■□□□□ 0.51
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.26■□□□□ 0.51
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PGGT1B-202ENST00000379615 TSPY8P0CW00 308 aa18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 NT5C2P49902 561 aa18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR25O00155 361 aa18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ORC4O43929 436 aa18.24■□□□□ 0.51
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PGGT1B-202ENST00000379615 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM22Q9NS69 142 aa18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TLR2O60603 784 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC45O75419 566 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TFAP4Q01664 338 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ACER1Q8TDN7 264 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf42Q96LP6 360 aa18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPY2A6NKD2 308 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 FKTNO75072 461 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 FGRP09769 529 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX10P56693 466 aa18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1B-202ENST00000379615 ATP2B2Q01814 1243 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF6Q15052 776 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LPAR1Q92633 364 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 NYAP2Q9P242 653 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TMX2Q9Y320 296 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TREML2Q5T2D2 321 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 IL25Q9H293 177 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 GOPCQ9HD26 462 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRFP10586 1907 aa18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRG0 241 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L15C9J2P7 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L11C9JVI0 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L18D6R9N7 530 aa18.2■□□□□ 0.5
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PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L19D6RCP7 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L20D6RJB6 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 SP3Q02447 781 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L24Q0WX57 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ESR2Q92731 530 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ERO1AQ96HE7 468 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.2■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL1O95922 423 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2C8P10632 490 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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