RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAMP4O75379 141 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST5P78524 1137 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIN2CQ14957 1233 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUSD4Q5VX71 490 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TREML1Q86YW5 311 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 MDFIQ99750 246 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSX2Q9BZM3 304 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 USTQ9Y2C2 406 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCC12Q96J65 1359 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNB5O14775 395 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIN3BO60391 1043 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDF11O95390 407 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NTSR2O95665 410 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE6BP35913 854 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCIRG1Q13488 830 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCSK7Q16549 785 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIM2Q9P1W9 311 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHD4Q14839 1912 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 H0YIN7 160 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPHP1O15259 732 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRGNP10124 158 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 DGKGP49619 791 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PARP10Q53GL7 1025 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NLRP10Q86W26 655 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NYXQ9GZU5 481 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 STIM2Q9P246 746 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTMR7Q9Y216 660 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 E9PSI1 815 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP3K6O95382 1288 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 YY1P25490 414 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADH7P40394 386 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSK3AP49840 483 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE4CQ08493 712 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLFN5Q08AF3 891 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 G2E3Q7L622 706 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADCY9O60503 1353 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 OPLAHO14841 1288 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 EGFRP00533 1210 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 STYK1Q6J9G0 422 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTLL6Q8N841 843 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 MASTLQ96GX5 879 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 STK31Q9BXU1 1019 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACNA1SQ13698 1873 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNFRSF10BO14763 440 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFKB1P19838 968 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRY2Q49AN0 593 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYNE4Q8N205 404 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF428Q96B54 188 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARID3AQ99856 593 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAMB2P55268 1798 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACNA1FO60840 1977 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLX4Q8IY92 1834 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPR1P16066 1061 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 KSR2Q6VAB6 950 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYD88Q99836 296 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms