RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 KLHL34Q8N239 644 aa20.63■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.63■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SLFN14P0C7P3 912 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CERS3Q8IU89 383 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TSPY26PQ9H489 355 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 PDE4BQ07343 736 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CLIC6Q96NY7 704 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 IFNAR1P17181 557 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 COA1Q9GZY4 146 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP45Q9UL16 551 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 PCNTO95613 3336 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 GSTO1P78417 241 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 STK38Q15208 465 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 RGS22Q8NE09 1264 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TSPY3P0CV98 308 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TSPY8P0CW00 308 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CDKL5O76039 1030 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 FGRP09769 529 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 LDHCP07864 332 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 USP40Q9NVE5 1235 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 WNT7AO00755 349 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 RASA1P20936 1047 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CDK8P49336 464 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 PPP4CP60510 307 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 PKN1Q16512 942 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ELP1O95163 1332 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ECE2O60344 883 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 GRIN1Q05586 938 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 FSIP1Q8NA03 581 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM29Q14134 588 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 SBK1Q52WX2 424 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 TNMDQ9H2S6 317 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4D-204ENST00000358923 ORC4O43929 436 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 FUT2Q10981 343 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFA8P51970 172 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 PNMA1Q8ND90 353 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 CABP5Q9NP86 173 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 RAD17O75943 681 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 DPEP1P16444 411 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 ANO1Q5XXA6 986 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 ISM2Q6H9L7 571 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 TMTC2Q8N394 836 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 EYA3Q99504 573 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 SCN9AQ15858 1988 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 YDJCA8MPS7 323 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 SPTLC2O15270 562 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 CAPN2P17655 700 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 TERF2Q15554 542 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 KAT14Q9H8E8 782 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 USP25Q9UHP3 1055 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 RAD21O60216 631 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 MMP1P03956 469 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms