RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 PAPPAQ13219 1627 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 C21orf2O43822 256 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 HAUS7Q99871 368 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 HPSEQ9Y251 543 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 DACH1Q9UI36 760 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NGLY1Q96IV0 654 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TEX33O43247 280 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 STIM1Q13586 685 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GBP6Q6ZN66 633 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NLRP10Q86W26 655 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 AIFM3Q96NN9 605 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 EYA2O00167 538 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 KIF3CO14782 793 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 VPS37DQ86XT2 251 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 MYO6Q9UM54 1294 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ADORA1P30542 326 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 RESP18Q5W5W9 173 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GREM2Q9H772 168 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 PPP6R2O75170 966 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ZNF18P17022 549 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ITPK1Q13572 414 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NR1I3Q14994 352 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 MIEF2Q96C03 454 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 PRC1O43663 620 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ABL1P00519 1130 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ALG1Q9BT22 464 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 SHTN1A0MZ66 631 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 H0YHG0 523 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ZMYND10O75800 440 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 INPP5BP32019 993 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GGCXP38435 758 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 BIRC2Q13490 618 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 POSTNQ15063 836 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 MLKLQ8NB16 471 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 KAT14Q9H8E8 782 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TJP1Q07157 1748 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 C11orf91Q3C1V1 193 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 WDR93Q6P2C0 686 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.46■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 CASP14P31944 242 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 SIK1P57059 783 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 PI16Q6UXB8 463 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 STX17P56962 302 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.45■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 SNAP23O00161 211 aa20.44■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 IRAK1P51617 712 aa20.44■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PKP3-201ENST00000331563 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms