RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 GDF11O95390 407 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 GH2P01242 217 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 ASNSP08243 561 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 GUCY1A2P33402 732 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 KLRG1Q96E93 195 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 CEP95Q96GE4 821 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF18-201ENST00000320054 TTLL1O95922 423 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 RCAN1P53805 252 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 JAG1P78504 1218 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 APOBRQ0VD83 1088 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 MAP3K11Q16584 847 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 DLK2Q6UY11 383 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 WRNIP1Q96S55 665 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SENP2Q9HC62 589 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 NYAP2Q9P242 653 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 MYH6P13533 1939 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC69A6NI79 296 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 KIF3CO14782 793 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SEPT2Q15019 361 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 APOA5Q6Q788 366 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 MKL1Q969V6 931 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TMX3Q96JJ7 454 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 KAT14Q9H8E8 782 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 STX8Q9UNK0 236 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 NID2Q14112 1375 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PTPRFP10586 1907 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 UNCXA6NJT0 531 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TRAF5O00463 557 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 INPP5BP32019 993 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ICA1Q05084 483 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ME3Q16798 604 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ZBTB43O43298 467 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PFKFB2O60825 505 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 DDAH1O94760 285 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CALM1P0DP23 149 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CALM2P0DP24 149 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CALM3P0DP25 149 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 FKBP1BP68106 108 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 MAP3K9P80192 1104 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PNMA1Q8ND90 353 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 MAP3K14Q99558 947 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 USP17L5A8MUK1 530 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 LARGE1O95461 756 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TROAPQ12815 778 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CUL4AQ13619 759 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PRKG1Q13976 671 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PPP2R5BQ15173 497 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SH2D4AQ9H788 454 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PICK1Q9NRD5 415 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 FZD1Q9UP38 647 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 YY1P25490 414 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 GTF3C6Q969F1 213 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 WDR18Q9BV38 432 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 TMX2Q9Y320 296 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 CSADQ9Y600 493 aa15.9■□□□□ 0.14
PRPF18-201ENST00000320054 PTPRAP18433 802 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPF18-201ENST00000320054 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
PRPF18-201ENST00000320054 ATP2B2Q01814 1243 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPF18-201ENST00000320054 VGLL4Q14135 290 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPF18-201ENST00000320054 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms