RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319041.6

SH3BGRL3-202, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CFAP45Q9UL16 551 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 STX8Q9UNK0 236 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ELP1O95163 1332 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NMT2O60551 498 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PHKBQ93100 1093 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FZD9O00144 591 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DTNBO60941 627 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SHMT1P34896 483 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TCP10Q12799 353 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GRM4Q14833 912 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NBPF11Q86T75 865 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM83AQ86UY5 434 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DPF2Q92785 391 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FIBPO43427 364 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TNNI2P48788 182 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CACNB3P54284 484 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RASSF7Q02833 373 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM151AQ8WW52 585 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CEP95Q96GE4 821 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TTLL1O95922 423 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FOSBP53539 338 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UBE2HP62256 183 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TNFAIP1Q13829 316 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KRT40Q6A162 431 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CSRNP1Q96S65 589 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PPFIA3O75145 1194 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 AKR1B1P15121 316 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LMNB1P20700 586 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SMARCA1P28370 1054 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GUCY1B3Q02153 619 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FUT2Q10981 343 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TATDN1Q6P1N9 297 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 USP48Q86UV5 1035 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SPATA32Q96LK8 384 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 VEZTQ9HBM0 779 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CLRN2A0PK11 232 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MMP1P03956 469 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GSE1Q14687 1217 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DNAJC18Q9H819 358 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WNT10BO00744 389 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 AIFM3Q96NN9 605 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CABP5Q9NP86 173 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms