RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317419.7

RABGAP1-201, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 2,186 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-201ENST00000317419 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 RABEP1Q15276 862 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 DGKHQ86XP1 1220 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 CEP95Q96GE4 821 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 NYAP2Q9P242 653 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 NMT2O60551 498 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 PTPRAP18433 802 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 CHST3Q7LGC8 479 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGAP1-201ENST00000317419 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 MKL1Q969V6 931 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 CSADQ9Y600 493 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TNKSO95271 1327 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 WDR18Q9BV38 432 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 USP17L5A8MUK1 530 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 LIFRP42702 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 LY9Q9HBG7 655 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 PICK1Q9NRD5 415 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ICA1Q05084 483 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TTLL1O95922 423 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ERO1BQ86YB8 467 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 NEK4P51957 841 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 PPATQ06203 517 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 Q6ZUG5 572 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ELP3Q9H9T3 547 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 A0A1W2PRG0 241 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 EVCP57679 992 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SENP2Q9HC62 589 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 WTAPQ15007 396 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TMTC2Q8N394 836 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TMX2Q9Y320 296 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 APLP1P51693 650 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 HUNKP57058 714 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ACER1Q8TDN7 264 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ERICH2A1L162 156 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 PPIL2Q13356 520 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 STX8Q9UNK0 236 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGAP1-201ENST00000317419 GJA5P36382 358 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 ECE1P42892 770 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 AK2P54819 239 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 CREBZFQ9NS37 354 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 OPTNQ96CV9 577 aa22.19■■□□□ 1.14
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RABGAP1-201ENST00000317419 ANKRD1Q15327 319 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.18■■□□□ 1.14
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RABGAP1-201ENST00000317419 RGMBQ6NW40 437 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 SH2D4AQ9H788 454 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 USP17L10C9JJH3 530 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 BACE1P56817 501 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 SPP2Q13103 211 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 C12orf42Q96LP6 360 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 KAT14Q9H8E8 782 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 C19orf81C9J6K1 198 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGAP1-201ENST00000317419 RCAN1P53805 252 aa22.16■■□□□ 1.14
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