RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.8■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 C17orf99Q6UX52 265 aa29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 ACER1Q8TDN7 264 aa29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 PNMA3Q9UL41 463 aa29.79■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.78■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.78■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.77■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.77■■■□□ 2.36
CXCL2-201ENST00000296031 USP14P54578 494 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 PPARAQ07869 468 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ALX1Q15699 326 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM17Q9Y577 477 aa29.76■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 RASA1P20936 1047 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 OSBPP22059 807 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ABHD8Q96I13 439 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 C12orf42Q96LP6 360 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 PRDM1O75626 825 aa29.74■■■□□ 2.35
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CXCL2-201ENST00000296031 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 CAP1Q01518 475 aa29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ICA1Q05084 483 aa29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 KIF22Q14807 665 aa29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PRG0 241 aa29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 EFCC1Q9HA90 598 aa29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 FGAP02671 866 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 BCRP11274 1271 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 PDE4BQ07343 736 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGEF6Q15052 776 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.72■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.71■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 CAPN15O75808 1086 aa29.7■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2B2Q01814 1243 aa29.7■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 IFFO2Q5TF58 517 aa29.7■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.7■■■□□ 2.35
CXCL2-201ENST00000296031 VCAM1P19320 739 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 SKAP1Q86WV1 359 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 SH2D4AQ9H788 454 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 TMX2Q9Y320 296 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 ZMYM6O95789 1325 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 MGAMO43451 1857 aa29.68■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L15C9J2P7 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L11C9JVI0 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L18D6R9N7 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L22D6RA61 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L19D6RCP7 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L20D6RJB6 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 PSMC4P43686 418 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L24Q0WX57 530 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 CHMLP26374 656 aa29.66■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 HERVK_113P62684 666 aa29.66■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 CTGFP29279 349 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM47Q96LD4 638 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 INCENPQ9NQS7 918 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 GNRH1P01148 92 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 TSPY3P0CV98 308 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 TSPY8P0CW00 308 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 HAND2P61296 217 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 TFAP4Q01664 338 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.64■■■□□ 2.34
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